CGI aide Caprion à acquérir une plate-forme de bio-informatique puissante pour ses recherches médicales

Caprion, une entreprise de biotechnologie spécialisée en protéomique (l’étude de la nature et des fonctions des protéines dans le corps humain), avait besoin d’une puissance de calcul et d’une capacité de mémoire gigantesques pour prendre en charge les algorithmes que son laboratoire élabore afin de faciliter les recherches et d’accélérer le processus de découverte de médicaments.

Pour se faire une idée de la quantité des données générées dans son centre d’analyse des données, il suffit d’indiquer qu’un seul spectromètre de masse en service 24 heures sur 24, sept jours sur sept, produit 4 téraoctets de données par an – assez pour remplir une rangée de disquettes placées côte à côte sur une distance de 200 kilomètres. Caprion prévoit que 18 de ces machines seront en ligne à la fin de la mise en œuvre.

Comme Caprion cherchait une entreprise ayant une expertise dans le développement et l’installation de grands systèmes et dans la gestion d’infrastructures technologiques, elle a fait appel à CGI pour l’aider à acquérir et à installer une plate-forme de bio-informatique puissante qui répondrait aux besoins de ses recherches.

Le défi
Pour CGI, c’était un défi majeur à relever. L’entreprise devait non seulement agir en tant qu’expert en intégration de systèmes, en gestion de projet et en services-conseils, mais aussi en tant qu’expert en développement d’un logiciel de soutien connexe.

Ce logiciel devait permettre aux scientifiques d’intégrer les données biologiques générées par le centre et, avec la puissance de calcul disponible, d’analyser et de stocker les données sur les différences protéiniques existant entre les cellules saines et les cellules malades.

Le défi le plus important était de respecter l’échéancier extrêmement serré établi pour le projet : moins de six mois pour achever la mise en œuvre de la plate-forme en même temps que le processus de gestion était défini, que l’équipe de projet Caprion était sélectionnée et intégrée et alors que les fonctions de calcul et les infrastructures étaient inexistantes.

La stratégie
Alors que Caprion se préparait à déménager dans son nouveau centre de recherche, CGI a commencé par héberger l’équipement de Caprion et par gérer le site Web temporaire de l’entreprise.

Au même moment, CGI élaborait un plan pour l’installation de CellCarta, une plate-forme de bio-informatique, avec Sun Microsystems et Oracle comme partenaires.

Ensemble, Caprion et CGI ont choisi des processeurs puissants fabriqués par Sun (connus pour leur fiabilité) et des bases de données d’Oracle (également bien connues pour leur capacité pratiquement illimitée). Certains outils de développement Oracle ont également été choisis.

CGI a ensuite été chargée du projet d’installation CellCarta qui était divisé en plusieurs sous-projets devant être exécutés par Sun Microsystems, Oracle et CGI afin d’assurer l’intégration des diverses composantes de calcul en une solution unique et complète.

Une équipe, composée de plus de 30 consultants prêtés par CGI et par ses partenaires, a travaillé sur ce projet en étroite collaboration avec l’équipe de Caprion.

" Cette coopération a été remarquable à tous les niveaux, CGI ayant joué un rôle vital comme principal responsable des opérations ", a remarqué M. Paul Kearney, directeur de la bio-informatique chez Caprion.

En septembre, quand Caprion a emménagé dans ses nouveaux bureaux, un groupe important de consultants de CGI étaient présents pour s’assurer que la première phase du projet portant sur le centre d’analyse des données était menée à terme comme prévu et que toutes les composantes étaient opérationnelles et compatibles.

En plus d’installer la plate-forme CellCarta, CGI s’est chargée des applications de bureautique et de réseau de Caprion et est devenue le fournisseur de services Internet de l’entreprise, lui assurant l’accès à Internet ainsi qu’à son centre d’analyse des données.

La technologie

• Serveurs Sun Microsystems
  
• Bases de données Oracle
  
• Logiciel de soutien de CGI

Les résultats
La première phase de la mise en œuvre s’est avérée une réussite complète.

" Il ne fait aucun doute que CGI a fait beaucoup pour nous, a déclaré Paul Kearney. CGI a joué un rôle vital dans la mise en œuvre de notre centre d’analyse des données et nous avons été très impressionnés par le degré de coopération qui existait avec Sun Microsystems et Oracle. "

À la fin de la première phase, CGI s’est vu octroyer un contrat de cinq ans pour le soutien et la maintenance de l’équipement.